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- Faculdade de Medicina (FM) 239
- Faculdade de Medicina Veterinária (FAVET) 119
- Faculdade de Nutrição (FANUT) 109
- Instituto de Biociências (IB) 312
- Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais (ICAA) – Sinop 232
- Instituto de Ciências Agrárias e Tecnológicas (ICAT) – Rondonópolis 113
- Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde (ICBS) – Araguaia 90
- Instituto de Ciências da Saúde (ICS) - Sinop 67
- Instituto de Ciências Exatas e da Terra (ICET) 445
- Instituto de Ciências Exatas e da Terra (ICET) – Araguaia 134
- Instituto de Ciências Exatas e Naturais (ICEN) – Rondonópolis 5
- Instituto de Ciências Humanas e Sociais (ICHS) 487
- Instituto de Ciências Humanas e Sociais (ICHS) – Rondonópolis 282
- Instituto de Ciências Naturais, Humanas e Sociais (ICNHS) – Sinop 162
- Instituto de Educação (IE) 865
- Instituto de Física (IF) 467
- Instituto de Geografia, História e Documentação (IGHD) 279
- Instituto de Linguagens (IL) 401
- Instituto de Saúde Coletiva (ISC) 237
- Institutos de Ciências da Saúde (ICS) – Sinop 4