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http://ri.ufmt.br/handle/1/6693
Registro completo de metadados
Campo DC | Valor | Idioma |
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dc.creator | Costa, Rita Baldini da | - |
dc.date.accessioned | 2025-04-02T16:38:30Z | - |
dc.date.available | 2024-11-26 | - |
dc.date.available | 2025-04-02T16:38:30Z | - |
dc.date.issued | 2022-08-29 | - |
dc.identifier.citation | COSTA, Rita Baldini da. Identificação molecular de espécies de Characidium (Characiformes: Crenuchidae) de diferentes bacias hidrográficas neotropicais. 2022. 36 f. Dissertação (Mestrado em Zoologia) - Universidade Federal de Mato Grosso, Instituto de Biociências, Cuiabá, 2022. | pt_BR |
dc.identifier.uri | http://ri.ufmt.br/handle/1/6693 | - |
dc.description.abstract | Characidium is the largest genus, in number of valid species (83), of the Crenuchidae. It is widely distributed in the Neotropical region, living in streams, lakes and lowland swamps. It is a cryptic genus in systematics due to its complex morphological delimitation. Therefore, this study aimed to use the DNA barcoding technique to identify the species of Characidium, seeking subsidies to understand its tributary diversity from the Upper Paraguay, Madeira, Tapajós and Xingu basins. The dataset is composed of 124 sequences of the COI gene of Characidium, of which 106 were collected in the present study in the Upper Paraguay (70), Madeira (9), Tapajós (15) and Xingu (12) basins. A priori, they were identified based on morphological characters such as: C. zebra (32), C. aff. steindachneri (4), C. xavante (16), C. laterale (10) and 7 probable new species Characidium sp.1 (11), Characidium sp.2 (4), Characidium sp.3 (8), Characidium sp.4 (2), Characidium sp.5 (4), Characidium sp.6 (9) and Characidium sp.7 (2). To compose the dataset, nine sequences available in the BOLD Systems database were added, namely: C. zebra (9), C. marshi (2), C. lagosantensis (1), C. gomesi (2), C fasciatum (2), C. rachovii (1), C. alopioi (1), C. xanthopterum (1), C. schubarti (1), C. oiticicai (1) and C. phoxocephalum (1). The results revealed a 612 bases pair (bp) sequence of the mitochondrial Cytochrome C oxidase subunit 1 (COI) gene fragment. The OT species delimitation analyzes indicated the presence of 20 Molecular Operational Taxonomic Units (MOTUs) while bPTP identified 25 MOTUs. On the other hand, ASAP and GMYC revealed 23 MOTUs, which were considered in this study as consensus MOTUS, of which two contain C. gomesi and six distinct MOTUs are composed of C. zebra. In the present work, it is evident that the species identified as C. zebra (Madeira and Upper Paraguay) form a distinct group from the species of C. zebra deposited in BOLD. As described in the literature C. zebra is considered a species complex. Our data corroborate that the species currently described as C. zebra lacks more detailed studies, integrating molecular and morphological data for a better understanding of its taxonomic status. The boundary analyzes also revealed three possible sympatric species: C. zebra, C. aff. steindachneri and Characidium sp.1 in the Aricá-açu river (Upper Paraguay). In the Santana River (Upper Paraguay) the presence of C. zebra and Characidium sp.4 was verified, also in sympatry. Finally, the present work reveals that the Characidium diversity is underestimated for the sampled region, indicating the possible presence of at least four new species for the region. | pt_BR |
dc.description.provenance | Submitted by Nádia Paes (nadia66paes@gmail.com) on 2025-03-26T12:29:07Z No. of bitstreams: 1 DISS_2022_Rita Baldini da Costa.pdf: 6117981 bytes, checksum: 3f066e5d246aa87d8f04b96af4ca84cb (MD5) | en |
dc.description.provenance | Approved for entry into archive by Auxiliadora Moura (auxiliadora.moura@ufmt.br) on 2025-04-02T16:38:30Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISS_2022_Rita Baldini da Costa.pdf: 6117981 bytes, checksum: 3f066e5d246aa87d8f04b96af4ca84cb (MD5) | en |
dc.description.provenance | Made available in DSpace on 2025-04-02T16:38:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISS_2022_Rita Baldini da Costa.pdf: 6117981 bytes, checksum: 3f066e5d246aa87d8f04b96af4ca84cb (MD5) Previous issue date: 2022-08-29 | en |
dc.description.sponsorship | CAPES | pt_BR |
dc.description.sponsorship | CNPq | pt_BR |
dc.description.sponsorship | FAPEMAT | pt_BR |
dc.language | por | pt_BR |
dc.publisher | Universidade Federal de Mato Grosso | pt_BR |
dc.rights | Acesso Aberto | pt_BR |
dc.title | Identificação molecular de espécies de Characidium (Characiformes: Crenuchidae) de diferentes bacias hidrográficas neotropicais | pt_BR |
dc.type | Dissertação | pt_BR |
dc.subject.keyword | DNA barcode | pt_BR |
dc.subject.keyword | Peixes neotropicais | pt_BR |
dc.subject.keyword | Espécies crípticas | pt_BR |
dc.contributor.advisor1 | Ferreira, Daniela Cristina | - |
dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/4880526235013142 | pt_BR |
dc.contributor.referee1 | Ferreira, Daniela Cristina | - |
dc.contributor.referee1Lattes | http://lattes.cnpq.br/4880526235013142 | pt_BR |
dc.contributor.referee2 | Venere, Paulo César | - |
dc.contributor.referee2Lattes | http://lattes.cnpq.br/0397087873707987 | pt_BR |
dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/9030974124681206 | pt_BR |
dc.description.resumo | Characidium é o maior gênero em número de espécies válidas (83), da família Crenuchidae. Está amplamente distribuído na região Neotropical vivendo em riachos, lagoas e banhados de baixada. É um gênero críptico em sistemática devido a sua complexa delimitação morfológica. Diante disso, o presente estudo teve como objetivo utilizar a técnica de DNA barcoding para identificar as espécies de Characidium buscando subsídios para compreender a sua diversidade nos afluentes das bacias do Alto Paraguai, Madeira, Tapajós e Xingu. O conjunto de dados é composto por 124 sequências do gene COI de Characidium, sendo destas, 106 coletadas no presente estudo nas bacias do Alto Paraguai (70), Madeira (9), Tapajós (15) e Xingu (12). A priori os exemplares foram identificados com base em caracteres morfológicos como: C. aff. zebra (32), C. aff. steindachneri (4), C. xavante (16), C. laterale (10) e sete prováveis novas espécies, Characidium sp.1 (11), Characidium sp.2 (4), Characidium sp.3 (8), Characidium sp.4 (2), Characidium sp.5 (4), Characidium sp.6 (9) e Characidium sp.7 (2). Para compor o conjunto de dados, foram adicionadas nove sequências disponíveis no banco de dados BOLD Systems, sendo eles: C. zebra (9), C. marshi (2), C. lagosantensis (1), C. gomesi (2), C. fasciatum (2), C. rachovii (1), C. alipioi (1), C. xanthopterum (1), C. schubarti (1), C. oiticicai (1) e C. phoxocephalum (1). Os resultados revelaram sequências com 612 pares de bases (pb) do fragmento do gene mitocondrial Citocromo C oxidase subunidade | (COI). A análise de delimitação de espécies Threshold ótimo (OT) indicou a presença de 20 Unidades Taxonômicas Operacionais Moleculares (MOTUs), enquanto bPTP identificou 25 MOTUs. Já, as análises ASAP e GMYC revelaram 23 MOTUs, as quais foram consideradas neste estudo como MOTUS consenso, sendo, duas MOTUs para C. gomesi e seis MOTUs distintas para a espécie nominal C. zebra. No presente trabalho fica evidente que as espécies identificadas como C. zebra (Madeira e Alto Paraguai) formam um grupo distinto das espécies de C. zebra da Guyana depositadas no BOLD, confirmando que C. zebra é um complexo de espécies. Nossos dados corroboram que exemplares identificados como C. zebra carecem de estudos mais detalhados, integrando dados moleculares a morfológicos para melhor compreensão do seu status taxonômico. As análises de delimitação também revelaram três possíveis espécies simpátricas: C. zebra, C. aff. steindachneri e Characidium sp.1 no Rio Aricá-açu (Alto Paraguai). No Rio Santana (Alto Paraguai) foi verificada a presença de C. zebra e Characidium sp.4, também em simpatria. Por fim, o presente trabalho revela que a diversidade de Characidium está subestimada para a região amostrada, indicando a possibilidade da presença de pelo menos quatro novas espécies para a região. | pt_BR |
dc.publisher.country | Brasil | pt_BR |
dc.publisher.department | Instituto de Biociências (IB) | pt_BR |
dc.publisher.initials | UFMT CUC - Cuiabá | pt_BR |
dc.publisher.program | Programa de Pós-Graduação em Zoologia | pt_BR |
dc.subject.cnpq | CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA | pt_BR |
dc.subject.keyword2 | DNA barcode | pt_BR |
dc.subject.keyword2 | Neotropical fish | pt_BR |
dc.subject.keyword2 | Cryptic species | pt_BR |
dc.contributor.referee3 | Foresti, Fausto | - |
dc.contributor.referee3Lattes | http://lattes.cnpq.br/0804793944846367 | pt_BR |
dc.contributor.referee4 | Silva, Hugmar Pains da | - |
dc.contributor.referee4Lattes | http://lattes.cnpq.br/5549695522657628 | pt_BR |
Aparece na(s) coleção(ções): | CUC – IB – PPGZOO – Dissertações de mestrado |
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